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Cultures de Diatomées en milieu naturel
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Matériel de culture

Commentaires

 Objectifs :
 - Collecter des espèces benthiques
 - Identifier et photographier ces espèces
 - Mesurer les vitesses de colonisation
 - Appliquer une série annuelle de mesures
 - Développer des cultures sélectives
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Espèces cibles
Genre
15/03/03
 19/04/03 05/05/03 18/05/03 01/06/03 29/06/03 27/07/03 09/08/03 24/08/03 23/09/03
Type
Navicula 
grande taille
100
26
280 
 82
 410
82 
 85
67
 25
13
Diatomées 
sigmoïdes
39
2
 0
 4
 2
 1
 5
4
 4
2
Type
Amphora,
53
4
 100
 22
 25
 0
 4
76
 110
0
Undatella,
Ampblyamphora
5
10
 2
16 
 0
 0
 0
0
 6
2
Nitzschia 
grande taille /
petite taille
92 / 16
17 / 250
 88/nc
 11/510
58/600 
 2/460
 7/480
15/360
 5/250
1/20
Forme 
Licmophora
longues /
courtes
1/nc
100 / 34
650/nc
42/nc
16/120
6/20 
 3/0
0/6
 0
0
Striatella
0
7
 62
 0
 3
 0
 4
0
 1
0
Dyctiocha
3
0
 0
0 
 0
 0
0 
0
 0
0
Profondeur (m)
 
26
8
 8
 8
 8
 8
 8
8
8 
8
Temps de culture
 
14jours
14jours
14jours
15jours 
14jours
 14jours
15jours
13 jours
 15jours
17jours
Température
 
12 °C
13°C
 14°C
14°
16° 
 20-17°
 18°
23° 
20-23°
22°
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Commentaires
    Premier essai:
          Réalisé à l'aide du premier type de support (tasseau de bois, lames insérées dans deux fentes et en eau libre). La culture de 26 mètres a été réussie et celle de 7 mètres à moitié et sans résultat significatif. Cela a tout de même permis d'effectuer une série de mesures de densité d'individus et de définir certaines espèces cibles qui seront retenues pour la suite des opérations.
     Suite des opérations:
          Fabrication du deuxième support (base en béton avec inserts pour 4 lames, protection par élastiques ..en attendant de trouver mieux !). Prévision de mouiller ce support en fin de semaine 14 pour un minimum de 52 semaines. Récupération et échange des lames toutes les deux semaines. Mesure de la densité d'individus selon le même protocole et enregistrement.
     Mesure de la densité d'individus:
          Utilisation d'un grossissement de 160 (16x10) et parcours de 5 travers de lames de 26 mm: 
surface scrutée = 150 mm²
          Prévision d'effectuer un autre support de 10 lames pour effectuer des courbes de colonisation sur 30 jours.
          Prévision d'effectuer la même analyse en sortie du canal du Rove (autres espèces cibles)
     Deuxième culture:
          Lame très colonisée par des cellules de type Cocooneis:  environ 800 à 1000 / mm² sur la majeure partie de la lame.
Bord de la lame plus colonisé que le centre par l'ensemble des espèces.
     Troisième culture:
          Lames beaucoup plus colonisées que la fois précédente. Cocooneis en nombre inférieur au centre et supérieur sur les bords (300 à 1200 cellules / mm²). Bord de la lame colonisé à 95 % par endroits de petites formes diverses, et localement de diatomées triangulaires, de cellules en éventail (type Meridion), de Striatella ou encore de chaînes de Navicula ou autres frustules rectangulaire en vue connective.
     Quatrième culture:
          Lames très pauvres en grandes diatomées, colonisation en forte régression. "Cocooneis" nombreux par endroits et autres parties colonisées par une forme en deux haricots opposés et de même taille que "Cocooneis".
     Cinquième culture:
          Milieu perturbé par l'abondance d'Asparagospsis mortes qui jonchent le fond (et aussi un peu la plate-forme). Cocooneis en régression: aucun endroit n'atteint 1000 cellules / mm².
     Sixième culture:
          Culture détruite, retrouvée plus loin sans lame.
     Sixième culture version 2:
          Population très pauvre. Récupéré seulement deux lames, dont une assez déserte ! les "Navicula" comptées ont de petite taille comparé à l'habitude. une seule lame comportait de nombreuses "Nitzchia".
     Septième culture:
          Lames beaucoup plus chargées que le deux précédentes fois avec de nombreuses diatomées minuscules et des Cocooneis. Une lame (sur les trois récupérées) était fortement colonisée de chaînes ou Diatomées longues avec des séries d'une dizaine de chloroplastes (à déterminer). Il semble que la colonisation de certaines espèces se fasse par zone et que ces zones s'étendent en étant très largement dominées par une seule espèce.
     Huitième culture:
          Peu de changement, sauf la présence (surtout sur une lame) de diatomées de forme "Amphora" (apparemment des "Cymbella"). Les lames sont surtout colinisées par des cellules de taille inférieure aux "Cocooneis". Forte présence d'inverébrés vermiformes oranges.
     Neuvième culture:
         Retour progressif de la forme "Amphora" et net recul des "Nitchia". Lames toujours très colonisées de très petites formes
    Dixième culture:
         Lames très colonisées par des diatomées inférieures à 20 µm. Peu de "Cocooneis".
    Onzième culture:
         Détruite par la tempête et .... !